Os microscópios de luz simples usam uma lente, enquanto os microscópios de luz compostos usam mais de uma lente para criar uma imagem ampliada. Os microscópios de fluorescência são um tipo especializado de microscópio óptico que cria imagens de marcadores fluorescentes que são anexados a proteínas ou compostos específicos em uma amostra.. Microscópio Óptico. É também um tipo comum de microscópio. Usa a luz para iluminar estruturas para o observador por meio de lentes de refração e oculares de vidro. Microscópios fluorescentes funcionam pelo mesmo princípio, mas usam um comprimento de onda diferente de luz.

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Técnicas de microscopia. As lentes, os filtros e a iluminação do microscópio podem ser manipulados para ampliar, resolver e intensificar uma variedade de imagens. O tipo de amostra usada e a documentação que necessita fazer determinam qual o método a ser escolhido, são eles: Campo Claro; Campo Escuro; Contraste de Fases;. A principal diferença entre as objetivas do microscópio é o design, a qualidade da imagem e os métodos de pesquisa. As objetivas acromáticas apresentam aberrações esféricas e cromáticas reduzidas. Este tipo de objetiva tem um campo de foco plano no meio 65% do campo de visão.